En 1886, se creó el Ministerio de Gobierno, con funciones de policía y gendarmería nacional, Archivo Nacional, correos y telégrafos, higiene y salubridad. Así mismo estuvo encargado del sistema penitenciario, personal y material de la Corte Suprema, Tribunales, Juzgados, Ministerio Público, Notario, y Registradores de Instrumentos públicos y privados y anotadores de hipotecas; elecciones, identificación electoral o de negocios electorales hasta la creación de la organización electoral por la Ley 89 de 1948. La función de control de Intendencias y Comisarías o Territorios Nacionales hasta la creación del Departamento Administrativo de Intendencias y Comisarías, "DAINCO", en 1975. La Atención y Prevención de Desastres, asignadas al Ministerio por reorganización del Departamento Administrativo de la Presidencia de la República, desde 1991. Se adicionan a la estructura interna del Ministerio de Gobierno la Dirección de Asuntos para las Comunidades Negras con la función de formular políticas en materia de comunidades negras de acuerdo con la Comisión Consultiva de Alto Nivel, velar por el respeto y cumplimiento de los principios de igualdad, identidad y autonomía cultural de las comunidades negras. En 1995, mediante la Ley 199 se transformó el Ministerio de Gobierno en Ministerio del Interior con funciones de formular y adoptar las políticas correspondientes a las siguientes materias: el ordenamiento y la autonomía territorial; las relaciones entre la Nación y las entidades territoriales en materia de la política de descentralización y el desarrollo institucional, entre otros. En el año 2003, a través de la Ley 790 de 2002, se dio paso a la fusión del Ministerio del Interior y de de Justicia y del Derecho, debido a que no se cumplió con el objetivo de esta fusión, el 04 de mayo de 2011, el Presidente de la República, Juan Manuel Santos, sanciono la Ley 1444, con la cual se ordena la escisión del Ministerio del Interior y de Justicia. El 11 de agosto de 2011, bajo Decreto 2893, revive el Ministerio del Interior.
